(レポート) DAT204 – Thermo Fisher事例：AWSとMongoDBによる質量分析時間の短縮 #reinvent

AWS re:Invent 2016

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菊池修治

2016.12.20

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こんにちは、菊池です。

re:Inventの事例セッション、"How Thermo Fisher Is Reducing Mass Spectrometry Experiment Times from Days to Minutes with MongoDB & AWS (DAT204)"の動画を視聴しましたのでレポートします。

スピーカーはMongoDB, Inc. CTOのEliot Horowitz氏と、Thermo Fisher社のJoseph Clicker氏でした。

レポート

Thermo Fisherによる事例

Thermo Fisher社
- 50カ国、従業員50,000人、売り上げ規模$170億
- 質量分析装置の開発
  - 農薬や汚染物質の検出
  - 2020年には火星探査機にスペクトロメータを載せる
Thermo Fisher Cloud（デモ）
- 質量分析器を接続し、リモートモニタリングを可能に

なぜMongoDBを使うのか
- Thermo FisherアプリケーションはMongoDBを利用している
- 科学技術アプリケーションは膨大なデータを扱う
- 選択理由
  - パフォーマンス
  - 開発生産性
  - コスト
  - どこでも動作する
  - 法規対応
MongoDBの進化

MySQL vs MongoDB
- インサート
  - MySQL最適化の40行のコードとMongoDBの1行のコード
  - MongoDBの方が6倍高速
- Select
  - リファクタリングで3.5倍のコード削減
マイクロサービスで構築
- AWS Lambda
- Docker / Amazon ECS
- Spark / EMR
MongoDB Atlasを9月から運用
- ストレスの多い週末から解放
- 付加価値を顧客に還元できるように

MongoDB Atlas on AWS

MongoDBの利点
- アプリケーションの開発に集中できる
- データ構造を自由にできる
MongoDB Atlas
- MongoDBから提供される、AWSで稼働するマネージドサービス
- より楽にアプリケーションを開発するために
- すぐに稼働し、スケール可能
- 必要な監視を提供
- データベースを管理するのに必要な数多くのタスクから解放される
MongoDB Atlasのデプロイと機能
- スペックを数クリックで指定
  - RAMとCPU
  - ノード数
  - ディスクサイズ
- 一度作成後も上記のスペックを停止時間なしで変更可能
- シャーディングの有効化
- セキュリティ
  - IPホワイトリスト（セキュリティグループ）
  - VPCピアリング
  - SSL証明書による認証
- モニタリング
  - MMS（MongoDB Monitoring Service：2011から5年提供してきた）
- バックアップ
  - 2014年から提供してきた
- Atlasは上記、モニタリング/バックアップサービスの上に稼働
- AtlasはAWSで稼働
  - 現在は少なくとも3つのAZを持つリージョンでのみサービス提供
- VPCピアリングは特に重要な機能
  - 自分のAWSアカウントIDとVPCを入れて有効化
  - Atlasとのトラフィックがプライベートネットワークになる
- Atlasを選択する理由
  - 信頼性
  - セキュリティ
  - 簡単
  - 価格
Mongo Mirror (2017 Q1登場予定）
- 現在稼働しているMongoDBクラスタをリアルタイムにAtlasへ移行