Bioinformaticsの記事一覧

ハーバード大学医学大学院様の事例から約230万 vCPU を利用してドッキングシミュレーションを実現した大規模なクラウド HPC 環境を学んでみた

大村 保貴

2022.10.03

配列解析 NCBI BLAST+ を EC2（Ubuntu 20.04）にセットアップして解析処理を走らせてみた

大村 保貴

2022.09.05

ゲノムブラウザ JBrowse2 で Gene model track のインポートをしてみた

大村 保貴

2022.08.08

ゲノムブラウザ JBrowse2 をグローバル IP 制限付きで簡単に Web 公開してみた

大村 保貴

2022.07.05

AWS ParallelCluster で クラウド HPC を構築し BUSCO を実行してみる

大村 保貴

2022.06.18

ゲノムブラウザ JBrowse2 を CloudFront + S3 で Web 公開してみた

大村 保貴

2022.06.15

ゲノムブラウザ JBrowse 2 を Docker コンテナで Web サービスするローカル実行環境を作成してみた

大村 保貴

2022.04.30

Bioconda のコンテナイメージをベースにツールのインストールと、AWS CLI をインストールしてみる

大村 保貴

2022.04.21

BioContainers で公開されているコンテナイメージに AWS CLI をインストールしてみる

大村 保貴

2022.04.19

AWS Batch で BUSCO を実行したときの “Metaeuk did not recognize any genes matching the dataset eukaryota_odb10 in the input file.” エラーの原因と対処方法

大村 保貴

2022.03.30

BUSCO コンテナを EC2 インスタンス で実行できる環境構築してローカルPC と処理速度の違いを比較してみる

大村 保貴

2022.03.17

BUSCO を ローカル PC の Docker コンテナで実行してみた

大村 保貴

2022.03.07

Galaxyを利用したゲノム解析へ入門 環境構築と基本操作編

大村 保貴

2021.05.02

ゲノムブラウザ IGV（Integrative Genomics Viewer）をAWS上に構築しリモート接続して利用してみる

大村 保貴

2021.04.30