# HPC の記事一覧

「AWS で挑むゲノム解析：普段使わない技術を知ろう」というタイトルで DevelopersIO 2024 Sapporo に登壇しました #devio2024

オンプレミスとクラウド HPC のハイブリッド構成の優位性とは？京都大学大学院医学研究科 附属ゲノム医学センター様の事例から学ぶ

Trinity のパフォーマンスモニタリング機能を Apptainer で動く Trinity コンテナで試してみた

Trinity 中間ファイルの保存先ストレージの違いで処理時間に影響あるのか確認してみた

Trinity インプットデータの保存先ストレージの違いで処理時間に影響あるのか確認してみた （S3 vs インスタンスストア）

AWS ParallelCluster のコンピュートノードのインスタンス ID からジョブ ID を特定する方法

AWS ParallelCluster Ubuntu 22.04 で Mountpoint for Amazon S3 を使ってヘッドノードとコンピュートノードに S3 バケットを自動マウントする方法

AWS ParallelCluster OnNodeConfigured セクションの Args を変更してもクラスターの更新をかけられないときに検討したこと

AWS ParallelCluster で Apptainer と Mountpoint for Amazon S3 の組み合わせて Trinity を実行してみた

AWS ParallelCluster で Apptainer を利用して Trinity を実行してみた

AWS ParallelCluster 3.3.0 から 3.9.0 特定の操作により共有ストレージのデータが削除される問題と対処方法について

AWS ParallelCluster で Apptainer を実行する Apptainer on ParallelCluster の実装方法

AWS 上で HPC 環境構築用の CloudFormation テンプレート集を提供する HPC Recipes for AWS について

AWS ParallelCluster カスタムブートストラップスクリプトでクラスターコンフィグから引数を受け取るスクリプトを試してみた

AWS ParallelCluster コンピュートフリートを停止しなくてもクラスターの設定変更をできる新機能を試してみた

AWS Batch ジョブが RUNNABLE 状態でスタックしたときにジョブの自動キャンセル設定をできるようになりました

AWS ParallelCluster CloudFormation のスタック作成速度向上によりクラスターのデプロイ速度は早くなったのか確認してみた

AWS ParallelCluster 3.9.0 で Slurm Queue の設定変更のためにコンピュートフリートを停止しなくて済むようになりました

AWS Batch のジョブキューがいつの間にか文字通りの FIFO の動作になっていたようなので動作確認してみた

AWS Bactch 指定した最大 vCPU 数を超える vCPU を持つインスタンスタイプが起動するのはなぜでしょうか？

AWS Batch で登場する IAM ロールの種類を絵に描いて整理してみた

AWS ParallelCluster ジョブをサブミット後にスポットインスタンスが起動してこない原因と対処方法 – サービスクォータ編

AWS ParallelCluster 既存クラスターの設定を変更する手順 – fish シェル編

AWS ParallelCluster で M7i / M7a インスタンスは利用可能なのか確認してみた

AWS ParallelCluster Slurm アカウンテイングのためのデータベースサービスについて考えた

S3 Express One Zone 用の VPC エンドポイント Gateway 型を作成する CloudFormation テンプレートの紹介

AWS ParallelCluster コンピュートノードはインスタンスメタデータからタグ情報を取得できるのでしょうか？

Amazon EC2 Capacity Blocks for ML をちょっと詳しくなろう

AWS ParallelCluster 3.8.0 でクラスタースケーリング戦略が追加されコンピュートノードの起動の仕方を選べるようになりました

AWS FIS のスポットインスタンスの中断アクションは AWS ParallelCluster のコンピュートノードにも使えるのでしょうか？

AWS ParallelCluster ジョブをサブミット後にスポットインスタンスが起動してこない原因と対処方法 – サービスリンクロール未作成編

Amzon EFS アーカイブと、One Zone 低頻度アクセスどちらが安いのか現実的なラインの利用費を試算をしてみた

re:Invent 2023 HPC 関連アップデート情報をまとめて紹介 #AWSreInvent

AWS Batch で並列演算ライブラリ Dask を利用したマルチノード並列ジョブを実行するワークショップに参加しました #AWSreInvent

Amazon FSx for Lustre から S3 への自動エクスポート機能のコスト考慮点

[アップデート]Amazon FSx for Lustre のスループット設定を構築後でも変更できるようになりました