大村 保貴

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網走が好きです。

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大村 保貴が執筆した記事

AWS Batch で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみた

大村 保貴

2023.06.10

Docker on GPU インスタンス(EC2)で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみた

大村 保貴

2023.06.07

AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたコンピュートノードの詳細モニタリング有効化を確認してみた

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2023.06.04

Docker コンテナで動く pcluster コマンドの実行環境の作り方紹介

大村 保貴

2023.06.03

AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたメモリ使用率とディスク使用率のメトリクスを確認してみた

大村 保貴

2023.05.28

うるう年にかかる EC2 の Reserved Instances / Savings Plans の終了日について

大村 保貴

2023.05.27

AWS ParallelCluster 3.6.0 で RHEL 8 をサポートしました

大村 保貴

2023.05.23

[アップデート] Amazon Omics Storage のシーケンスストアへファイルを直接保存できるようになりました

大村 保貴

2023.05.21

Nextflow 入門 Hello World ワークフローの実行内容を解説

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2023.05.20

Nextflow の概要と AWS サービスとの関係性を IT エンジニア向けに紹介

大村 保貴

2023.05.14

[アップデート] AWS Batch のダッシュボード表示をカスタマイズできるようになりました

大村 保貴

2023.05.11

EC2(Ubuntu 22.04 LTS)に Nextflow の実行環境を構築してみた

大村 保貴

2023.05.03

Nextflow のローカル開発環境のために Docker コンテナを利用してみてわかったこと

大村 保貴

2023.05.03

AWS Batch で OpenMPI を使った並列ジョブの実行をやってみた

大村 保貴

2023.05.03

AWS Batch プレイスメントグループの指定ミスでサブミットしたジョブが [RUNNABLE] のまま止まっているときの対処方法

大村 保貴

2023.04.29

S3 へユーザー認証付きでファイルをアップロードする Amplify のサンプルアプリを試してみた

大村 保貴

2023.04.23

AWS ParallelCluster の計算リソースでかかった費用を把握する方法を調べてみた

大村 保貴

2023.04.22

VPC Lattice の VPC Lattice Service を Resource Access Manager で共有してクロスアカウント接続をやってみた

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2023.04.19

[アップデート] Amazon EFS の Elastic Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました

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2023.04.18

VPC Lattice クロスアカウント接続に必要な要素を図解してみた

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2023.04.17

AWS ParallelCluster ヘッドノードとコンピュートノードの IAM ロールに複数の IAM ポリシーをアタッチするコンフィグの記述方法

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2023.04.11

CloudWatch Logs 取り込みデータ量の多いロググループ名の確認方法

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2023.04.05

Amazon EBS Snapshots Archive の制約事項と AMI をアーカイブするために検討したことをまとめました

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2023.04.02

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2023.04.01

Bioconda 入門 Anaconda、Minicondaとの違いと EC2 に実行環境をセットアップしてみた

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2023.03.28

Amazon S3 バケットのリクエスタ支払いをスイッチロール先のアカウントから受け付ける方法

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2023.03.26

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2023.03.23

【書評】新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門

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2023.03.21

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2023.03.19

ChatGPT を使ってちょうど読んでいた論文を3行まとめにしてもらった

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2023.03.17

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2023.03.12

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2023.03.11

AWS ParallelCluster クラスター単位でコスト配分タグを付与するコンフィグ設定

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2023.03.07

Amazon Omics Workflows ZIP 圧縮したワークフロー定義ファイルのディレクトリ構成を誤った場合のエラーの出力例

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2023.03.04

Amazon Omics Storage に保存したファイルのメタデータから files の項目が表示されるケースとされないケースの違いを調べてみた

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2023.02.26

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2023.02.22

Amazon Omics Analytics へ GFF ファイルをインポートする前に拡張子を確認しましょう

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2023.02.22

Amazon Omics Analytics に保存したバリアントファイルとアノテーションファイルを Athena から検索してみた

大村 保貴

2023.02.18

Amazon Omics Analytics の Annotaion Store へファイルインポートに失敗したときの切り分け方法

大村 保貴

2023.02.15

Amazon Omics を利用するときに役に立つ資料まとめ2023年版

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2023.02.12

Amazon Omics に登場するデータフォーマットを整理してみた

大村 保貴

2023.02.11

Amazon Omics Analytics のアノテーションストアへデータ保存時の関連要素を図解してみた

大村 保貴

2023.02.06

リファレンスゲノムがまだこの世に存在しないけど Amazon Omics Storage へリードを保存したいときに試した方法

大村 保貴

2023.02.04

Amazon Omics Storage リファレンスストアは圧縮したファイル形式には対応していないためインポートする前に確認しましょう

大村 保貴

2023.02.04

AWS ParallelCluster 3 では共有ストレージのマウント先に /mnt 直下を指定できなくなりました

大村 保貴

2023.01.31

Amazon Omics Storage マネージメントコンソールからシーケンスストアへインポートジョブの実行方法が改善されました

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2023.01.24

Amazon Omics Storage と S3 でゲノムデータを保存する場合のコストを比較してみた

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2023.01.20

Amzon Omics Storage からリファレンスストアを削除するための前提条件を確認してみた

大村 保貴

2023.01.18

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大村 保貴

2023.01.17

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2023.01.16

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2023.01.15

EBS ボリュームの状態がエラーになったときの対処方法

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2023.01.14

AWS ParallelCluster 3.4.0 でコンピュートノードのマルチ AZ 起動をサポートしました

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2023.01.11

Amazon CloudWatch Logs の PutLogEvents API の単一ログストリームあたりのリクエストクォータがなくなり制限が緩和されました

大村 保貴

2023.01.05

4K 解像度対応の NICE DCV でリモート接続してみる

大村 保貴

2022.12.31

AWS App Runner を動かしてみたくてワークショップをやってみた

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2022.12.27

Amazon EFS のスループットモード Bursting から Elastic へ AWS CLI で手軽にモードを切り替えてみた

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2022.12.24

Amazon EFS の Elastic Throughput モードと Bursting Throughput モードでファイルの読み書きしてスループットを確認してみた

大村 保貴

2022.12.23

ioping コマンドを Graviton(ARM)インスタンスで利用する手順

大村 保貴

2022.12.16

re:Invent 2022 HPC 関連アップデート情報をまとめて紹介 #reinvent

大村 保貴

2022.12.13