大村 保貴

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網走が好きです。

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大村 保貴が執筆した記事

AWS ParallelCluster に Mountpoint for Amazon S3 を使って S3 バケットをマウントする方法

大村 保貴

2023.08.22

Mountpoint for Amazon S3 を HPC 用途で利用するときの考慮事項

大村 保貴

2023.08.20

AWS ParallelCluster のコンピュートノードでベアメタルインスタンスを使ってみた

大村 保貴

2023.08.17

リージョン毎のスポット価格も瞬時に確認できるスポット価格調査に便利な spotinfo の紹介

大村 保貴

2023.08.14

Transit Gateway アタッチメントの接続先一覧を CSV 形式で出力してみた

大村 保貴

2023.08.05

AWS Batch のスポットインスタンスの配分戦略にスポット価格と中断率の両方を考慮するいい塩梅の戦略が追加されました

大村 保貴

2023.08.03

AWS Organizations 配下のメンバーアカウントがアクセスした AWS サービス の最終アクセス履歴を取得する

大村 保貴

2023.07.31

AWS Organizations 管理下の全アカウントの Trusted Advisor による指摘事項を確認できる「組織ビュー」のレポートで確認・可視化できる内容を調べてみた

大村 保貴

2023.07.24

AWS Systems Manager セッションマネージャーで接続時に毎回 AWS ParallelCluster に関連するメッセージが出力されるときの原因

大村 保貴

2023.07.23

AMI のフルバックアップを可能な限り安価に長期間保存したくて S3 Glacier Deep Archive に保存してみた

大村 保貴

2023.07.21

AWS Step Functions から直接 AWS Batch のジョブ実行開始を試してみた

大村 保貴

2023.07.17

『VPC 間通信ができる新サービス VPC Lattice』というタイトルで DevelopersIO 2023 札幌に登壇しました #devio2023

大村 保貴

2023.07.16

VPC 間接続を気軽に試せる VPC Lattice ワークショップをやってみた

大村 保貴

2023.07.08

AWS Backup のタグ指定バックアップでタグの指定を誤り期待通りに動かなかったときの原因と対処方法

大村 保貴

2023.07.07

Amazon Omics Workflows の対応言語に CWL が追加されたのでワークフローを実行してみた

大村 保貴

2023.07.04

AWS が公開しているサーバレスなゲノム解析環境を構築してみた

大村 保貴

2023.07.02

HPC 向けに最適化された AWS Graviton 3E 搭載の Hpc7g インスタンスが一般提供開始されました

大村 保貴

2023.06.30

[アップデート] Amazon EFS の Provisioned Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました

大村 保貴

2023.06.24

システムの RTO/RPO を確認・維持するために役立つ AWS Resilience Hub のワークショップをやってみた

大村 保貴

2023.06.23

EC2(Ubuntu 22.04)で Nextflow と Bioconda が実行可能な環境構築手順

大村 保貴

2023.06.17

Bioconda でインストールした salmon コマンド実行に libboost_iostreams.so.1.60.0: cannot open shared object とエラーが出力されたときの対処方法

大村 保貴

2023.06.16

conda 環境で特定ディレクトリ配下に移動すると自動的に仮想環境をアクティベートする方法

大村 保貴

2023.06.11

AWS Batch で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみた

大村 保貴

2023.06.10

Docker on GPU インスタンス(EC2)で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみた

大村 保貴

2023.06.07

AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたコンピュートノードの詳細モニタリング有効化を確認してみた

大村 保貴

2023.06.04

Docker コンテナで動く pcluster コマンドの実行環境の作り方紹介

大村 保貴

2023.06.03

AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたメモリ使用率とディスク使用率のメトリクスを確認してみた

大村 保貴

2023.05.28

うるう年にかかる EC2 の Reserved Instances / Savings Plans の終了日について

大村 保貴

2023.05.27

AWS ParallelCluster 3.6.0 で RHEL 8 をサポートしました

大村 保貴

2023.05.23

[アップデート] Amazon Omics Storage のシーケンスストアへファイルを直接保存できるようになりました

大村 保貴

2023.05.21

Nextflow 入門 Hello World ワークフローの実行内容を解説

大村 保貴

2023.05.20

Nextflow の概要と AWS サービスとの関係性を IT エンジニア向けに紹介

大村 保貴

2023.05.14

[アップデート] AWS Batch のダッシュボード表示をカスタマイズできるようになりました

大村 保貴

2023.05.11

EC2(Ubuntu 22.04 LTS)に Nextflow の実行環境を構築してみた

大村 保貴

2023.05.03

Nextflow のローカル開発環境のために Docker コンテナを利用してみてわかったこと

大村 保貴

2023.05.03

AWS Batch で OpenMPI を使った並列ジョブの実行をやってみた

大村 保貴

2023.05.03

AWS Batch プレイスメントグループの指定ミスでサブミットしたジョブが [RUNNABLE] のまま止まっているときの対処方法

大村 保貴

2023.04.29

S3 へユーザー認証付きでファイルをアップロードする Amplify のサンプルアプリを試してみた

大村 保貴

2023.04.23

AWS ParallelCluster の計算リソースでかかった費用を把握する方法を調べてみた

大村 保貴

2023.04.22

VPC Lattice の VPC Lattice Service を Resource Access Manager で共有してクロスアカウント接続をやってみた

大村 保貴

2023.04.19

[アップデート] Amazon EFS の Elastic Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました

大村 保貴

2023.04.18

VPC Lattice クロスアカウント接続に必要な要素を図解してみた

大村 保貴

2023.04.17

AWS ParallelCluster ヘッドノードとコンピュートノードの IAM ロールに複数の IAM ポリシーをアタッチするコンフィグの記述方法

大村 保貴

2023.04.11

CloudWatch Logs 取り込みデータ量の多いロググループ名の確認方法

大村 保貴

2023.04.05

Amazon EBS Snapshots Archive の制約事項と AMI をアーカイブするために検討したことをまとめました

大村 保貴

2023.04.02

Amazon Omics Analytics の Variant Store へファイルの一括インポートができるようになりました

大村 保貴

2023.04.01

Bioconda 入門 Anaconda、Minicondaとの違いと EC2 に実行環境をセットアップしてみた

大村 保貴

2023.03.28

Amazon S3 バケットのリクエスタ支払いをスイッチロール先のアカウントから受け付ける方法

大村 保貴

2023.03.26

AWS Batch の Fargate タイプで最大 200 GiB のエフェメラルストレージを利用できるようになりました

大村 保貴

2023.03.23

【書評】新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門

大村 保貴

2023.03.21

Docker コンテナで動く Amazon Genomics CLI 実行環境の作り方紹介

大村 保貴

2023.03.19

ChatGPT を使ってちょうど読んでいた論文を3行まとめにしてもらった

大村 保貴

2023.03.17

Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ戻すまでの所要時間を調べてみた

大村 保貴

2023.03.12

Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ変更する方法2選

大村 保貴

2023.03.11

AWS ParallelCluster クラスター単位でコスト配分タグを付与するコンフィグ設定

大村 保貴

2023.03.07

Amazon Omics Workflows ZIP 圧縮したワークフロー定義ファイルのディレクトリ構成を誤った場合のエラーの出力例

大村 保貴

2023.03.04

Amazon Omics Storage に保存したファイルのメタデータから files の項目が表示されるケースとされないケースの違いを調べてみた

大村 保貴

2023.02.26

Amazon Omics Analytics の Annotation Store で定義可能なスキーマの型の確認方法

大村 保貴

2023.02.22

Amazon Omics Analytics へ GFF ファイルをインポートする前に拡張子を確認しましょう

大村 保貴

2023.02.22

Amazon Omics Analytics に保存したバリアントファイルとアノテーションファイルを Athena から検索してみた

大村 保貴

2023.02.18