developersIO

# Bioinformatics の記事一覧

Nextflow 入門 Hello World ワークフローの実行内容を解説
大村 保貴
2023.05.20
Nextflow の概要と AWS サービスとの関係性を IT エンジニア向けに紹介
大村 保貴
2023.05.14
EC2（Ubuntu 22.04 LTS）に Nextflow の実行環境を構築してみた
大村 保貴
2023.05.03
Nextflow のローカル開発環境のために Docker コンテナを利用してみてわかったこと
大村 保貴
2023.05.03
Amazon Omics Analytics の Variant Store へファイルの一括インポートができるようになりました
大村 保貴
2023.04.01
Bioconda 入門 Anaconda、Minicondaとの違いと EC2 に実行環境をセットアップしてみた
大村 保貴
2023.03.28
【書評】新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門
大村 保貴
2023.03.21
Docker コンテナで動く Amazon Genomics CLI 実行環境の作り方紹介
大村 保貴
2023.03.19
ChatGPT を使ってちょうど読んでいた論文を3行まとめにしてもらった
大村 保貴
2023.03.17
Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ戻すまでの所要時間を調べてみた
大村 保貴
2023.03.12
Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ変更する方法2選
大村 保貴
2023.03.11
Amazon Omics Workflows ZIP 圧縮したワークフロー定義ファイルのディレクトリ構成を誤った場合のエラーの出力例
大村 保貴
2023.03.04
Amazon Omics Storage に保存したファイルのメタデータから files の項目が表示されるケースとされないケースの違いを調べてみた
大村 保貴
2023.02.26
Amazon Omics入門(Omics Storageへデータ保存)
inomaso
2023.02.22
Amazon Omics Analytics の Annotation Store で定義可能なスキーマの型の確認方法
大村 保貴
2023.02.22
Amazon Omics Analytics へ GFF ファイルをインポートする前に拡張子を確認しましょう
大村 保貴
2023.02.22
Amazon Omics Analytics に保存したバリアントファイルとアノテーションファイルを Athena から検索してみた
大村 保貴
2023.02.18
Amazon Omics Analytics の Annotaion Store へファイルインポートに失敗したときの切り分け方法
大村 保貴
2023.02.15
Amazon Omics を利用するときに役に立つ資料まとめ2023年版
大村 保貴
2023.02.12
Amazon Omics に登場するデータフォーマットを整理してみた
大村 保貴
2023.02.11
Amazon Omics Analytics のアノテーションストアへデータ保存時の関連要素を図解してみた
大村 保貴
2023.02.06
リファレンスゲノムがまだこの世に存在しないけど Amazon Omics Storage へリードを保存したいときに試した方法
大村 保貴
2023.02.04
Amazon Omics Storage リファレンスストアは圧縮したファイル形式には対応していないためインポートする前に確認しましょう
大村 保貴
2023.02.04
Amazon Omics Storage マネージメントコンソールからシーケンスストアへインポートジョブの実行方法が改善されました
大村 保貴
2023.01.24
Amazon Omics Storage と S3 でゲノムデータを保存する場合のコストを比較してみた
大村 保貴
2023.01.20
Amzon Omics Storage からリファレンスストアを削除するための前提条件を確認してみた
大村 保貴
2023.01.18
Amazon Omics Storage のリファレンスストアは1リージョンに1つまでの作成上限があります
大村 保貴
2023.01.17
Amazon Omics の Omics Storage へデータを保存する手順を図解してみた
大村 保貴
2023.01.16
4K 解像度対応の NICE DCV でリモート接続してみる
大村 保貴
2022.12.31
BioContainers のイメージが ECR Public で利用可能になりました
大村 保貴
2022.10.13
ハーバード大学医学大学院様の事例から約230万 vCPU を利用してドッキングシミュレーションを実現した大規模なクラウド HPC 環境を学んでみた
大村 保貴
2022.10.03
配列解析 NCBI BLAST+ を EC2（Ubuntu 20.04）にセットアップして解析処理を走らせてみた
大村 保貴
2022.09.05
ゲノムブラウザ JBrowse2 で Gene model track のインポートをしてみた
大村 保貴
2022.08.08
ゲノムブラウザ JBrowse2 をグローバル IP 制限付きで簡単に Web 公開してみた
大村 保貴
2022.07.05
AWS ParallelCluster で クラウド HPC を構築し BUSCO を実行してみる
大村 保貴
2022.06.18
ゲノムブラウザ JBrowse2 を CloudFront + S3 で Web 公開してみた
大村 保貴
2022.06.15
1
2
3