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網走が好きです。

大村 保貴ohmura-yasutaka

月別投稿数

668Posts
Docker コンテナで動く pcluster コマンドの実行環境の作り方紹介
大村 保貴
2023.06.03
AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたメモリ使用率とディスク使用率のメトリクスを確認してみた
大村 保貴
2023.05.28
うるう年にかかる EC2 の Reserved Instances / Savings Plans の終了日について
大村 保貴
2023.05.27
AWS ParallelCluster 3.6.0 で RHEL 8 をサポートしました
大村 保貴
2023.05.23
[アップデート] Amazon Omics Storage のシーケンスストアへファイルを直接保存できるようになりました
大村 保貴
2023.05.21
Nextflow 入門 Hello World ワークフローの実行内容を解説
大村 保貴
2023.05.20
Nextflow の概要と AWS サービスとの関係性を IT エンジニア向けに紹介
大村 保貴
2023.05.14
[アップデート] AWS Batch のダッシュボード表示をカスタマイズできるようになりました
大村 保貴
2023.05.11
EC2（Ubuntu 22.04 LTS）に Nextflow の実行環境を構築してみた
大村 保貴
2023.05.03
Nextflow のローカル開発環境のために Docker コンテナを利用してみてわかったこと
大村 保貴
2023.05.03
AWS Batch で OpenMPI を使った並列ジョブの実行をやってみた
大村 保貴
2023.05.03
AWS Batch プレイスメントグループの指定ミスでサブミットしたジョブが [RUNNABLE] のまま止まっているときの対処方法
大村 保貴
2023.04.29
S3 へユーザー認証付きでファイルをアップロードする Amplify のサンプルアプリを試してみた
大村 保貴
2023.04.23
AWS ParallelCluster の計算リソースでかかった費用を把握する方法を調べてみた
大村 保貴
2023.04.22
VPC Lattice の VPC Lattice Service を Resource Access Manager で共有してクロスアカウント接続をやってみた
大村 保貴
2023.04.19
[アップデート] Amazon EFS の Elastic Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました
大村 保貴
2023.04.18
VPC Lattice クロスアカウント接続に必要な要素を図解してみた
大村 保貴
2023.04.17
AWS ParallelCluster ヘッドノードとコンピュートノードの IAM ロールに複数の IAM ポリシーをアタッチするコンフィグの記述方法
大村 保貴
2023.04.11
CloudWatch Logs 取り込みデータ量の多いロググループ名の確認方法
大村 保貴
2023.04.05
Amazon EBS Snapshots Archive の制約事項と AMI をアーカイブするために検討したことをまとめました
大村 保貴
2023.04.02
Amazon Omics Analytics の Variant Store へファイルの一括インポートができるようになりました
大村 保貴
2023.04.01
Bioconda 入門 Anaconda、Minicondaとの違いと EC2 に実行環境をセットアップしてみた
大村 保貴
2023.03.28
Amazon S3 バケットのリクエスタ支払いをスイッチロール先のアカウントから受け付ける方法
大村 保貴
2023.03.26
AWS Batch の Fargate タイプで最大 200 GiB のエフェメラルストレージを利用できるようになりました
大村 保貴
2023.03.23
【書評】新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門
大村 保貴
2023.03.21
Docker コンテナで動く Amazon Genomics CLI 実行環境の作り方紹介
大村 保貴
2023.03.19
ChatGPT を使ってちょうど読んでいた論文を3行まとめにしてもらった
大村 保貴
2023.03.17
Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ戻すまでの所要時間を調べてみた
大村 保貴
2023.03.12
Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ変更する方法2選
大村 保貴
2023.03.11
AWS ParallelCluster クラスター単位でコスト配分タグを付与するコンフィグ設定
大村 保貴
2023.03.07
Amazon Omics Workflows ZIP 圧縮したワークフロー定義ファイルのディレクトリ構成を誤った場合のエラーの出力例
大村 保貴
2023.03.04
Amazon Omics Storage に保存したファイルのメタデータから files の項目が表示されるケースとされないケースの違いを調べてみた
大村 保貴
2023.02.26
Amazon Omics Analytics の Annotation Store で定義可能なスキーマの型の確認方法
大村 保貴
2023.02.22
Amazon Omics Analytics へ GFF ファイルをインポートする前に拡張子を確認しましょう
大村 保貴
2023.02.22
Amazon Omics Analytics に保存したバリアントファイルとアノテーションファイルを Athena から検索してみた
大村 保貴
2023.02.18
Amazon Omics Analytics の Annotaion Store へファイルインポートに失敗したときの切り分け方法
大村 保貴
2023.02.15
Amazon Omics を利用するときに役に立つ資料まとめ2023年版
大村 保貴
2023.02.12
Amazon Omics に登場するデータフォーマットを整理してみた
大村 保貴
2023.02.11
Amazon Omics Analytics のアノテーションストアへデータ保存時の関連要素を図解してみた
大村 保貴
2023.02.06
リファレンスゲノムがまだこの世に存在しないけど Amazon Omics Storage へリードを保存したいときに試した方法
大村 保貴
2023.02.04
Amazon Omics Storage リファレンスストアは圧縮したファイル形式には対応していないためインポートする前に確認しましょう
大村 保貴
2023.02.04
AWS ParallelCluster 3 では共有ストレージのマウント先に /mnt 直下を指定できなくなりました
大村 保貴
2023.01.31
Amazon Omics Storage マネージメントコンソールからシーケンスストアへインポートジョブの実行方法が改善されました
大村 保貴
2023.01.24
Amazon Omics Storage と S3 でゲノムデータを保存する場合のコストを比較してみた
大村 保貴
2023.01.20
Amzon Omics Storage からリファレンスストアを削除するための前提条件を確認してみた
大村 保貴
2023.01.18
Amazon Omics Storage のリファレンスストアは1リージョンに1つまでの作成上限があります
大村 保貴
2023.01.17
Amazon Omics の Omics Storage へデータを保存する手順を図解してみた
大村 保貴
2023.01.16
AWS ParallelCluster 3.4 で有効化できるプレイスメントグループの仕様を確認してみた
大村 保貴
2023.01.15
EBS ボリュームの状態がエラーになったときの対処方法
大村 保貴
2023.01.14
AWS ParallelCluster 3.4.0 でコンピュートノードのマルチ AZ 起動をサポートしました
大村 保貴
2023.01.11
Amazon CloudWatch Logs の PutLogEvents API の単一ログストリームあたりのリクエストクォータがなくなり制限が緩和されました
大村 保貴
2023.01.05
4K 解像度対応の NICE DCV でリモート接続してみる
大村 保貴
2022.12.31
AWS App Runner を動かしてみたくてワークショップをやってみた
大村 保貴
2022.12.27
Amazon EFS のスループットモード Bursting から Elastic へ AWS CLI で手軽にモードを切り替えてみた
大村 保貴
2022.12.24
Amazon EFS の Elastic Throughput モードと Bursting Throughput モードでファイルの読み書きしてスループットを確認してみた
大村 保貴
2022.12.23
ioping コマンドを Graviton（ARM）インスタンスで利用する手順
大村 保貴
2022.12.16
re:Invent 2022 HPC 関連アップデート情報をまとめて紹介 #reinvent
大村 保貴
2022.12.13
finch vm init 時に ssh: unable to authenticate, attempted methods [none publickey], no supported methods remain メッセージ出力時に確認したこと
大村 保貴
2022.12.11
英語で雑談するのに課題を感じたので Coursera の「Small Talk & Conversational Vocabulary」をやってみた
大村 保貴
2022.12.10
re:Invent で宿泊ホテルの予約手続きに失敗したときの対処事例 Mirage ホテル編
大村 保貴
2022.12.03