Bioconda 入門 Anaconda、Minicondaとの違いと EC2 に実行環境をセットアップしてみた

Amazon S3 バケットのリクエスタ支払いをスイッチロール先のアカウントから受け付ける方法

AWS Batch の Fargate タイプで最大 200 GiB のエフェメラルストレージを利用できるようになりました

【書評】新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門

Docker コンテナで動く Amazon Genomics CLI 実行環境の作り方紹介

ChatGPT を使ってちょうど読んでいた論文を3行まとめにしてもらった

Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ戻すまでの所要時間を調べてみた

Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ変更する方法2選

AWS ParallelCluster クラスター単位でコスト配分タグを付与するコンフィグ設定

Amazon Omics Workflows ZIP 圧縮したワークフロー定義ファイルのディレクトリ構成を誤った場合のエラーの出力例

Amazon Omics Storage に保存したファイルのメタデータから files の項目が表示されるケースとされないケースの違いを調べてみた

Amazon Omics Analytics の Annotation Store で定義可能なスキーマの型の確認方法

Amazon Omics Analytics へ GFF ファイルをインポートする前に拡張子を確認しましょう

Amazon Omics Analytics に保存したバリアントファイルとアノテーションファイルを Athena から検索してみた

Amazon Omics Analytics の Annotaion Store へファイルインポートに失敗したときの切り分け方法

Amazon Omics を利用するときに役に立つ資料まとめ2023年版

Amazon Omics に登場するデータフォーマットを整理してみた

Amazon Omics Analytics のアノテーションストアへデータ保存時の関連要素を図解してみた

リファレンスゲノムがまだこの世に存在しないけど Amazon Omics Storage へリードを保存したいときに試した方法

Amazon Omics Storage リファレンスストアは圧縮したファイル形式には対応していないためインポートする前に確認しましょう

AWS ParallelCluster 3 では共有ストレージのマウント先に /mnt 直下を指定できなくなりました

Amazon Omics Storage マネージメントコンソールからシーケンスストアへインポートジョブの実行方法が改善されました

Amazon Omics Storage と S3 でゲノムデータを保存する場合のコストを比較してみた

Amzon Omics Storage からリファレンスストアを削除するための前提条件を確認してみた

Amazon Omics Storage のリファレンスストアは1リージョンに1つまでの作成上限があります

Amazon Omics の Omics Storage へデータを保存する手順を図解してみた

AWS ParallelCluster 3.4 で有効化できるプレイスメントグループの仕様を確認してみた

EBS ボリュームの状態がエラーになったときの対処方法

AWS ParallelCluster 3.4.0 でコンピュートノードのマルチ AZ 起動をサポートしました

Amazon CloudWatch Logs の PutLogEvents API の単一ログストリームあたりのリクエストクォータがなくなり制限が緩和されました

4K 解像度対応の NICE DCV でリモート接続してみる

AWS App Runner を動かしてみたくてワークショップをやってみた

Amazon EFS のスループットモード Bursting から Elastic へ AWS CLI で手軽にモードを切り替えてみた

Amazon EFS の Elastic Throughput モードと Bursting Throughput モードでファイルの読み書きしてスループットを確認してみた

ioping コマンドを Graviton（ARM）インスタンスで利用する手順

re:Invent 2022 HPC 関連アップデート情報をまとめて紹介 #reinvent

finch vm init 時に ssh: unable to authenticate, attempted methods [none publickey], no supported methods remain メッセージ出力時に確認したこと

英語で雑談するのに課題を感じたので Coursera の「Small Talk & Conversational Vocabulary」をやってみた

re:Invent で宿泊ホテルの予約手続きに失敗したときの対処事例 Mirage ホテル編

「クラウド HPC のためのベストプラクティス」ワークショップに参加してきた #reinvnet #CMP305

[アップデート] Amazon FSx for OpenZFS に新しいデプロイタイプが追加されパフォーマンスが向上しました #reinvent

[速報] HPC向けに最適化されたインスタンスタイプ HPC6id が発表されました #reInvent

[レポート] HPC ワークロードを AWS を使ってモダンにしようチョークトークに恐る恐る参戦してきました #reinvent #ENU402

[レポート] Amazon FSx による HPC と ML の高速化に Deep dive #reinvent #STG343

AWS ParallelCluster 3.3.0 で追加された Slurm のデータベース接続設定により、従来の接続設定手順に影響があるのか調べました

AWS ParallelCluster Manager のバージョン違いで複数環境を持つときに検討してもらいたいこと

AWS WAF レートベースルールのカウントモードで検知したログの確認方法

WebUI の AWS ParallelCluster Manager と AWS ParallelCluster のバージョンの互換性を意識しよう

AWS Auto Scaling のスポットインスタンスの配分戦略にスポット価格と中断率の両方を考慮するいい塩梅の戦略が追加されました

AWS ParallelCluster ひとつのキューに複数のインスタンスタイプを登録して AllocationStrategy を試してみた

Account Factory から新規アカウント作成に失敗したアカウントを Service Catalog から更新かけて修正できるのか試してみた

AWS Control Tower に登録されている AWS アカウントを OU 間で移動して失敗したときの修正方法を確認してみた

AWS Control Tower Workshops の推奨講座をやってみた

AWS ParallelCluster 3.3.0 のアップデート紹介

AWS Batch の Fargate タイプで最大16vCPU, 120GiB メモリ指定できるようになりました

Account Factory から新規 AWS アカウント発行と、Organizations で管理していた AWS アカウントを Control Tower へ登録をやってみた

AWS Backup で ACL を無効化した S3 バケットのバックアップを取得して、同じ S3 バケットへリストアするときに気をつけたいこと

AWS Control Tower 既存の監査アカウントとログアーカイブアカウントを流用してランディングゾーンのセットアップをしてみた

BioContainers のイメージが ECR Public で利用可能になりました

AWS Control Tower のランディングゾーンセットアップ時に OU名が重複していてエラーになったときのリカバリ方法