大村 保貴
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大村 保貴が執筆した記事

Mountpoint for Amazon S3 を HPC 用途で利用するときの考慮事項Mountpoint for Amazon S3 を HPC 用途で利用するときの考慮事項
大村 保貴
2023.08.20
AWS ParallelCluster のコンピュートノードでベアメタルインスタンスを使ってみたAWS ParallelCluster のコンピュートノードでベアメタルインスタンスを使ってみた
大村 保貴
2023.08.17
リージョン毎のスポット価格も瞬時に確認できるスポット価格調査に便利な spotinfo の紹介リージョン毎のスポット価格も瞬時に確認できるスポット価格調査に便利な spotinfo の紹介
大村 保貴
2023.08.14
Transit Gateway アタッチメントの接続先一覧を CSV 形式で出力してみたTransit Gateway アタッチメントの接続先一覧を CSV 形式で出力してみた
大村 保貴
2023.08.05
AWS Batch のスポットインスタンスの配分戦略にスポット価格と中断率の両方を考慮するいい塩梅の戦略が追加されましたAWS Batch のスポットインスタンスの配分戦略にスポット価格と中断率の両方を考慮するいい塩梅の戦略が追加されました
大村 保貴
2023.08.03
AWS Organizations 配下のメンバーアカウントがアクセスした AWS サービス の最終アクセス履歴を取得するAWS Organizations 配下のメンバーアカウントがアクセスした AWS サービス の最終アクセス履歴を取得する
大村 保貴
2023.07.31
AWS Organizations 管理下の全アカウントの Trusted Advisor による指摘事項を確認できる「組織ビュー」のレポートで確認・可視化できる内容を調べてみたAWS Organizations 管理下の全アカウントの Trusted Advisor による指摘事項を確認できる「組織ビュー」のレポートで確認・可視化できる内容を調べてみた
大村 保貴
2023.07.24
AWS Systems Manager セッションマネージャーで接続時に毎回 AWS ParallelCluster に関連するメッセージが出力されるときの原因AWS Systems Manager セッションマネージャーで接続時に毎回 AWS ParallelCluster に関連するメッセージが出力されるときの原因
大村 保貴
2023.07.23
AMI のフルバックアップを可能な限り安価に長期間保存したくて S3 Glacier Deep Archive に保存してみたAMI のフルバックアップを可能な限り安価に長期間保存したくて S3 Glacier Deep Archive に保存してみた
大村 保貴
2023.07.21
AWS Step Functions から直接 AWS Batch のジョブ実行開始を試してみたAWS Step Functions から直接 AWS Batch のジョブ実行開始を試してみた
大村 保貴
2023.07.17
『VPC 間通信ができる新サービス VPC Lattice』というタイトルで DevelopersIO 2023 札幌に登壇しました #devio2023『VPC 間通信ができる新サービス VPC Lattice』というタイトルで DevelopersIO 2023 札幌に登壇しました #devio2023
大村 保貴
2023.07.16
VPC 間接続を気軽に試せる VPC Lattice ワークショップをやってみたVPC 間接続を気軽に試せる VPC Lattice ワークショップをやってみた
大村 保貴
2023.07.08
AWS Backup のタグ指定バックアップでタグの指定を誤り期待通りに動かなかったときの原因と対処方法AWS Backup のタグ指定バックアップでタグの指定を誤り期待通りに動かなかったときの原因と対処方法
大村 保貴
2023.07.07
Amazon Omics Workflows の対応言語に CWL が追加されたのでワークフローを実行してみたAmazon Omics Workflows の対応言語に CWL が追加されたのでワークフローを実行してみた
大村 保貴
2023.07.04
AWS が公開しているサーバレスなゲノム解析環境を構築してみたAWS が公開しているサーバレスなゲノム解析環境を構築してみた
大村 保貴
2023.07.02
HPC 向けに最適化された AWS Graviton 3E 搭載の Hpc7g インスタンスが一般提供開始されましたHPC 向けに最適化された AWS Graviton 3E 搭載の Hpc7g インスタンスが一般提供開始されました
大村 保貴
2023.06.30
[アップデート] Amazon EFS の Provisioned Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました[アップデート] Amazon EFS の Provisioned Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました
大村 保貴
2023.06.24
システムの RTO/RPO を確認・維持するために役立つ AWS Resilience Hub のワークショップをやってみたシステムの RTO/RPO を確認・維持するために役立つ AWS Resilience Hub のワークショップをやってみた
大村 保貴
2023.06.23
EC2（Ubuntu 22.04）で Nextflow と Bioconda が実行可能な環境構築手順EC2（Ubuntu 22.04）で Nextflow と Bioconda が実行可能な環境構築手順
大村 保貴
2023.06.17
Bioconda でインストールした salmon コマンド実行に libboost_iostreams.so.1.60.0: cannot open shared object とエラーが出力されたときの対処方法Bioconda でインストールした salmon コマンド実行に libboost_iostreams.so.1.60.0: cannot open shared object とエラーが出力されたときの対処方法
大村 保貴
2023.06.16
conda 環境で特定ディレクトリ配下に移動すると自動的に仮想環境をアクティベートする方法conda 環境で特定ディレクトリ配下に移動すると自動的に仮想環境をアクティベートする方法
大村 保貴
2023.06.11
AWS Batch で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみたAWS Batch で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみた
大村 保貴
2023.06.10
Docker on GPU インスタンス（EC2）で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみたDocker on GPU インスタンス（EC2）で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみた
大村 保貴
2023.06.07
AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたコンピュートノードの詳細モニタリング有効化を確認してみたAWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたコンピュートノードの詳細モニタリング有効化を確認してみた
大村 保貴
2023.06.04
Docker コンテナで動く pcluster コマンドの実行環境の作り方紹介Docker コンテナで動く pcluster コマンドの実行環境の作り方紹介
大村 保貴
2023.06.03
AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたメモリ使用率とディスク使用率のメトリクスを確認してみたAWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたメモリ使用率とディスク使用率のメトリクスを確認してみた
大村 保貴
2023.05.28
うるう年にかかる EC2 の Reserved Instances / Savings Plans の終了日についてうるう年にかかる EC2 の Reserved Instances / Savings Plans の終了日について
大村 保貴
2023.05.27
AWS ParallelCluster 3.6.0 で RHEL 8 をサポートしましたAWS ParallelCluster 3.6.0 で RHEL 8 をサポートしました
大村 保貴
2023.05.23
[アップデート] Amazon Omics Storage のシーケンスストアへファイルを直接保存できるようになりました[アップデート] Amazon Omics Storage のシーケンスストアへファイルを直接保存できるようになりました
大村 保貴
2023.05.21
Nextflow 入門 Hello World ワークフローの実行内容を解説Nextflow 入門 Hello World ワークフローの実行内容を解説
大村 保貴
2023.05.20
Nextflow の概要と AWS サービスとの関係性を IT エンジニア向けに紹介Nextflow の概要と AWS サービスとの関係性を IT エンジニア向けに紹介
大村 保貴
2023.05.14
[アップデート] AWS Batch のダッシュボード表示をカスタマイズできるようになりました[アップデート] AWS Batch のダッシュボード表示をカスタマイズできるようになりました
大村 保貴
2023.05.11
EC2（Ubuntu 22.04 LTS）に Nextflow の実行環境を構築してみたEC2（Ubuntu 22.04 LTS）に Nextflow の実行環境を構築してみた
大村 保貴
2023.05.03
Nextflow のローカル開発環境のために Docker コンテナを利用してみてわかったことNextflow のローカル開発環境のために Docker コンテナを利用してみてわかったこと
大村 保貴
2023.05.03
AWS Batch で OpenMPI を使った並列ジョブの実行をやってみたAWS Batch で OpenMPI を使った並列ジョブの実行をやってみた
大村 保貴
2023.05.03
AWS Batch プレイスメントグループの指定ミスでサブミットしたジョブが [RUNNABLE] のまま止まっているときの対処方法AWS Batch プレイスメントグループの指定ミスでサブミットしたジョブが [RUNNABLE] のまま止まっているときの対処方法
大村 保貴
2023.04.29
S3 へユーザー認証付きでファイルをアップロードする Amplify のサンプルアプリを試してみたS3 へユーザー認証付きでファイルをアップロードする Amplify のサンプルアプリを試してみた
大村 保貴
2023.04.23
AWS ParallelCluster の計算リソースでかかった費用を把握する方法を調べてみたAWS ParallelCluster の計算リソースでかかった費用を把握する方法を調べてみた
大村 保貴
2023.04.22
VPC Lattice の VPC Lattice Service を Resource Access Manager で共有してクロスアカウント接続をやってみたVPC Lattice の VPC Lattice Service を Resource Access Manager で共有してクロスアカウント接続をやってみた
大村 保貴
2023.04.19
[アップデート] Amazon EFS の Elastic Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました[アップデート] Amazon EFS の Elastic Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました
大村 保貴
2023.04.18
VPC Lattice クロスアカウント接続に必要な要素を図解してみたVPC Lattice クロスアカウント接続に必要な要素を図解してみた
大村 保貴
2023.04.17
AWS ParallelCluster ヘッドノードとコンピュートノードの IAM ロールに複数の IAM ポリシーをアタッチするコンフィグの記述方法AWS ParallelCluster ヘッドノードとコンピュートノードの IAM ロールに複数の IAM ポリシーをアタッチするコンフィグの記述方法
大村 保貴
2023.04.11
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2023.04.05
Amazon EBS Snapshots Archive の制約事項と AMI をアーカイブするために検討したことをまとめましたAmazon EBS Snapshots Archive の制約事項と AMI をアーカイブするために検討したことをまとめました
大村 保貴
2023.04.02
Amazon Omics Analytics の Variant Store へファイルの一括インポートができるようになりましたAmazon Omics Analytics の Variant Store へファイルの一括インポートができるようになりました
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2023.04.01
Bioconda 入門 Anaconda、Minicondaとの違いと EC2 に実行環境をセットアップしてみたBioconda 入門 Anaconda、Minicondaとの違いと EC2 に実行環境をセットアップしてみた
大村 保貴
2023.03.28
Amazon S3 バケットのリクエスタ支払いをスイッチロール先のアカウントから受け付ける方法Amazon S3 バケットのリクエスタ支払いをスイッチロール先のアカウントから受け付ける方法
大村 保貴
2023.03.26
AWS Batch の Fargate タイプで最大 200 GiB のエフェメラルストレージを利用できるようになりましたAWS Batch の Fargate タイプで最大 200 GiB のエフェメラルストレージを利用できるようになりました
大村 保貴
2023.03.23
【書評】新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門【書評】新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門
大村 保貴
2023.03.21
Docker コンテナで動く Amazon Genomics CLI 実行環境の作り方紹介Docker コンテナで動く Amazon Genomics CLI 実行環境の作り方紹介
大村 保貴
2023.03.19
ChatGPT を使ってちょうど読んでいた論文を3行まとめにしてもらったChatGPT を使ってちょうど読んでいた論文を3行まとめにしてもらった
大村 保貴
2023.03.17
Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ戻すまでの所要時間を調べてみたAmazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ戻すまでの所要時間を調べてみた
大村 保貴
2023.03.12
Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ変更する方法2選Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ変更する方法2選
大村 保貴
2023.03.11
AWS ParallelCluster クラスター単位でコスト配分タグを付与するコンフィグ設定AWS ParallelCluster クラスター単位でコスト配分タグを付与するコンフィグ設定
大村 保貴
2023.03.07
Amazon Omics Workflows ZIP 圧縮したワークフロー定義ファイルのディレクトリ構成を誤った場合のエラーの出力例Amazon Omics Workflows ZIP 圧縮したワークフロー定義ファイルのディレクトリ構成を誤った場合のエラーの出力例
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2023.03.04
Amazon Omics Storage に保存したファイルのメタデータから files の項目が表示されるケースとされないケースの違いを調べてみたAmazon Omics Storage に保存したファイルのメタデータから files の項目が表示されるケースとされないケースの違いを調べてみた
大村 保貴
2023.02.26
Amazon Omics Analytics の Annotation Store で定義可能なスキーマの型の確認方法Amazon Omics Analytics の Annotation Store で定義可能なスキーマの型の確認方法
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2023.02.22
Amazon Omics Analytics へ GFF ファイルをインポートする前に拡張子を確認しましょうAmazon Omics Analytics へ GFF ファイルをインポートする前に拡張子を確認しましょう
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2023.02.22
Amazon Omics Analytics に保存したバリアントファイルとアノテーションファイルを Athena から検索してみたAmazon Omics Analytics に保存したバリアントファイルとアノテーションファイルを Athena から検索してみた
大村 保貴
2023.02.18
Amazon Omics Analytics の Annotaion Store へファイルインポートに失敗したときの切り分け方法Amazon Omics Analytics の Annotaion Store へファイルインポートに失敗したときの切り分け方法
大村 保貴
2023.02.15
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