AWS ParallelCluster のコンピュートノードでベアメタルインスタンスを使ってみた

リージョン毎のスポット価格も瞬時に確認できるスポット価格調査に便利な spotinfo の紹介

Transit Gateway アタッチメントの接続先一覧を CSV 形式で出力してみた

AWS Batch のスポットインスタンスの配分戦略にスポット価格と中断率の両方を考慮するいい塩梅の戦略が追加されました

AWS Organizations 配下のメンバーアカウントがアクセスした AWS サービス の最終アクセス履歴を取得する

AWS Organizations 管理下の全アカウントの Trusted Advisor による指摘事項を確認できる「組織ビュー」のレポートで確認・可視化できる内容を調べてみた

AWS Systems Manager セッションマネージャーで接続時に毎回 AWS ParallelCluster に関連するメッセージが出力されるときの原因

AMI のフルバックアップを可能な限り安価に長期間保存したくて S3 Glacier Deep Archive に保存してみた

AWS Step Functions から直接 AWS Batch のジョブ実行開始を試してみた

『VPC 間通信ができる新サービス VPC Lattice』というタイトルで DevelopersIO 2023 札幌に登壇しました #devio2023

VPC 間接続を気軽に試せる VPC Lattice ワークショップをやってみた

AWS Backup のタグ指定バックアップでタグの指定を誤り期待通りに動かなかったときの原因と対処方法

Amazon Omics Workflows の対応言語に CWL が追加されたのでワークフローを実行してみた

AWS が公開しているサーバレスなゲノム解析環境を構築してみた

HPC 向けに最適化された AWS Graviton 3E 搭載の Hpc7g インスタンスが一般提供開始されました

[アップデート] Amazon EFS の Provisioned Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました

システムの RTO/RPO を確認・維持するために役立つ AWS Resilience Hub のワークショップをやってみた

EC2（Ubuntu 22.04）で Nextflow と Bioconda が実行可能な環境構築手順

Bioconda でインストールした salmon コマンド実行に libboost_iostreams.so.1.60.0: cannot open shared object とエラーが出力されたときの対処方法

conda 環境で特定ディレクトリ配下に移動すると自動的に仮想環境をアクティベートする方法

AWS Batch で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみた

Docker on GPU インスタンス（EC2）で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみた

AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたコンピュートノードの詳細モニタリング有効化を確認してみた

Docker コンテナで動く pcluster コマンドの実行環境の作り方紹介

AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたメモリ使用率とディスク使用率のメトリクスを確認してみた

うるう年にかかる EC2 の Reserved Instances / Savings Plans の終了日について

AWS ParallelCluster 3.6.0 で RHEL 8 をサポートしました

[アップデート] Amazon Omics Storage のシーケンスストアへファイルを直接保存できるようになりました

Nextflow 入門 Hello World ワークフローの実行内容を解説

Nextflow の概要と AWS サービスとの関係性を IT エンジニア向けに紹介

[アップデート] AWS Batch のダッシュボード表示をカスタマイズできるようになりました

EC2（Ubuntu 22.04 LTS）に Nextflow の実行環境を構築してみた

Nextflow のローカル開発環境のために Docker コンテナを利用してみてわかったこと

AWS Batch で OpenMPI を使った並列ジョブの実行をやってみた

AWS Batch プレイスメントグループの指定ミスでサブミットしたジョブが [RUNNABLE] のまま止まっているときの対処方法

S3 へユーザー認証付きでファイルをアップロードする Amplify のサンプルアプリを試してみた

AWS ParallelCluster の計算リソースでかかった費用を把握する方法を調べてみた

VPC Lattice の VPC Lattice Service を Resource Access Manager で共有してクロスアカウント接続をやってみた

[アップデート] Amazon EFS の Elastic Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました

VPC Lattice クロスアカウント接続に必要な要素を図解してみた

AWS ParallelCluster ヘッドノードとコンピュートノードの IAM ロールに複数の IAM ポリシーをアタッチするコンフィグの記述方法

CloudWatch Logs 取り込みデータ量の多いロググループ名の確認方法

Amazon EBS Snapshots Archive の制約事項と AMI をアーカイブするために検討したことをまとめました

Amazon Omics Analytics の Variant Store へファイルの一括インポートができるようになりました

Bioconda 入門 Anaconda、Minicondaとの違いと EC2 に実行環境をセットアップしてみた

Amazon S3 バケットのリクエスタ支払いをスイッチロール先のアカウントから受け付ける方法

AWS Batch の Fargate タイプで最大 200 GiB のエフェメラルストレージを利用できるようになりました

【書評】新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門

Docker コンテナで動く Amazon Genomics CLI 実行環境の作り方紹介

ChatGPT を使ってちょうど読んでいた論文を3行まとめにしてもらった

Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ戻すまでの所要時間を調べてみた

Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ変更する方法2選

AWS ParallelCluster クラスター単位でコスト配分タグを付与するコンフィグ設定

Amazon Omics Workflows ZIP 圧縮したワークフロー定義ファイルのディレクトリ構成を誤った場合のエラーの出力例

Amazon Omics Storage に保存したファイルのメタデータから files の項目が表示されるケースとされないケースの違いを調べてみた

Amazon Omics Analytics の Annotation Store で定義可能なスキーマの型の確認方法

Amazon Omics Analytics へ GFF ファイルをインポートする前に拡張子を確認しましょう

Amazon Omics Analytics に保存したバリアントファイルとアノテーションファイルを Athena から検索してみた

Amazon Omics Analytics の Annotaion Store へファイルインポートに失敗したときの切り分け方法

Amazon Omics を利用するときに役に立つ資料まとめ2023年版