AWS ParallelCluster 3.6.0 で RHEL 8 をサポートしました

[アップデート] Amazon Omics Storage のシーケンスストアへファイルを直接保存できるようになりました

Nextflow 入門 Hello World ワークフローの実行内容を解説

Nextflow の概要と AWS サービスとの関係性を IT エンジニア向けに紹介

[アップデート] AWS Batch のダッシュボード表示をカスタマイズできるようになりました

EC2（Ubuntu 22.04 LTS）に Nextflow の実行環境を構築してみた

Nextflow のローカル開発環境のために Docker コンテナを利用してみてわかったこと

AWS Batch で OpenMPI を使った並列ジョブの実行をやってみた

AWS Batch プレイスメントグループの指定ミスでサブミットしたジョブが [RUNNABLE] のまま止まっているときの対処方法

S3 へユーザー認証付きでファイルをアップロードする Amplify のサンプルアプリを試してみた

AWS ParallelCluster の計算リソースでかかった費用を把握する方法を調べてみた

VPC Lattice の VPC Lattice Service を Resource Access Manager で共有してクロスアカウント接続をやってみた

[アップデート] Amazon EFS の Elastic Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました

VPC Lattice クロスアカウント接続に必要な要素を図解してみた

AWS ParallelCluster ヘッドノードとコンピュートノードの IAM ロールに複数の IAM ポリシーをアタッチするコンフィグの記述方法

CloudWatch Logs 取り込みデータ量の多いロググループ名の確認方法

Amazon EBS Snapshots Archive の制約事項と AMI をアーカイブするために検討したことをまとめました

Amazon Omics Analytics の Variant Store へファイルの一括インポートができるようになりました

Bioconda 入門 Anaconda、Minicondaとの違いと EC2 に実行環境をセットアップしてみた

Amazon S3 バケットのリクエスタ支払いをスイッチロール先のアカウントから受け付ける方法

AWS Batch の Fargate タイプで最大 200 GiB のエフェメラルストレージを利用できるようになりました

【書評】新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門

Docker コンテナで動く Amazon Genomics CLI 実行環境の作り方紹介

ChatGPT を使ってちょうど読んでいた論文を3行まとめにしてもらった

Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ戻すまでの所要時間を調べてみた

Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ変更する方法2選

AWS ParallelCluster クラスター単位でコスト配分タグを付与するコンフィグ設定

Amazon Omics Workflows ZIP 圧縮したワークフロー定義ファイルのディレクトリ構成を誤った場合のエラーの出力例

Amazon Omics Storage に保存したファイルのメタデータから files の項目が表示されるケースとされないケースの違いを調べてみた

Amazon Omics Analytics の Annotation Store で定義可能なスキーマの型の確認方法

Amazon Omics Analytics へ GFF ファイルをインポートする前に拡張子を確認しましょう

Amazon Omics Analytics に保存したバリアントファイルとアノテーションファイルを Athena から検索してみた

Amazon Omics Analytics の Annotaion Store へファイルインポートに失敗したときの切り分け方法

Amazon Omics を利用するときに役に立つ資料まとめ2023年版

Amazon Omics に登場するデータフォーマットを整理してみた

Amazon Omics Analytics のアノテーションストアへデータ保存時の関連要素を図解してみた

リファレンスゲノムがまだこの世に存在しないけど Amazon Omics Storage へリードを保存したいときに試した方法

Amazon Omics Storage リファレンスストアは圧縮したファイル形式には対応していないためインポートする前に確認しましょう

AWS ParallelCluster 3 では共有ストレージのマウント先に /mnt 直下を指定できなくなりました

Amazon Omics Storage マネージメントコンソールからシーケンスストアへインポートジョブの実行方法が改善されました

Amazon Omics Storage と S3 でゲノムデータを保存する場合のコストを比較してみた

Amzon Omics Storage からリファレンスストアを削除するための前提条件を確認してみた

Amazon Omics Storage のリファレンスストアは1リージョンに1つまでの作成上限があります

Amazon Omics の Omics Storage へデータを保存する手順を図解してみた

AWS ParallelCluster 3.4 で有効化できるプレイスメントグループの仕様を確認してみた

EBS ボリュームの状態がエラーになったときの対処方法

AWS ParallelCluster 3.4.0 でコンピュートノードのマルチ AZ 起動をサポートしました

Amazon CloudWatch Logs の PutLogEvents API の単一ログストリームあたりのリクエストクォータがなくなり制限が緩和されました

4K 解像度対応の NICE DCV でリモート接続してみる

AWS App Runner を動かしてみたくてワークショップをやってみた

Amazon EFS のスループットモード Bursting から Elastic へ AWS CLI で手軽にモードを切り替えてみた

Amazon EFS の Elastic Throughput モードと Bursting Throughput モードでファイルの読み書きしてスループットを確認してみた

ioping コマンドを Graviton（ARM）インスタンスで利用する手順

re:Invent 2022 HPC 関連アップデート情報をまとめて紹介 #reinvent

finch vm init 時に ssh: unable to authenticate, attempted methods [none publickey], no supported methods remain メッセージ出力時に確認したこと

英語で雑談するのに課題を感じたので Coursera の「Small Talk & Conversational Vocabulary」をやってみた

re:Invent で宿泊ホテルの予約手続きに失敗したときの対処事例 Mirage ホテル編

「クラウド HPC のためのベストプラクティス」ワークショップに参加してきた #reinvnet #CMP305

[アップデート] Amazon FSx for OpenZFS に新しいデプロイタイプが追加されパフォーマンスが向上しました #reinvent

[速報] HPC向けに最適化されたインスタンスタイプ HPC6id が発表されました #reInvent