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網走が好きです。

大村 保貴ohmura-yasutaka

月別投稿数

617Posts
HPC 向けに最適化された AWS Graviton 3E 搭載の Hpc7g インスタンスが一般提供開始されました
大村 保貴
2023.06.30
[アップデート] Amazon EFS の Provisioned Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました
大村 保貴
2023.06.24
システムの RTO/RPO を確認・維持するために役立つ AWS Resilience Hub のワークショップをやってみた
大村 保貴
2023.06.23
EC2（Ubuntu 22.04）で Nextflow と Bioconda が実行可能な環境構築手順
大村 保貴
2023.06.17
Bioconda でインストールした salmon コマンド実行に libboost_iostreams.so.1.60.0: cannot open shared object とエラーが出力されたときの対処方法
大村 保貴
2023.06.16
conda 環境で特定ディレクトリ配下に移動すると自動的に仮想環境をアクティベートする方法
大村 保貴
2023.06.11
AWS Batch で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみた
大村 保貴
2023.06.10
Docker on GPU インスタンス（EC2）で CUDA コンテナの実行環境を作って Hello World を実行してみた
大村 保貴
2023.06.07
AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたコンピュートノードの詳細モニタリング有効化を確認してみた
大村 保貴
2023.06.04
Docker コンテナで動く pcluster コマンドの実行環境の作り方紹介
大村 保貴
2023.06.03
AWS ParallelCluster 3.6.0 で追加されたメモリ使用率とディスク使用率のメトリクスを確認してみた
大村 保貴
2023.05.28
うるう年にかかる EC2 の Reserved Instances / Savings Plans の終了日について
大村 保貴
2023.05.27
AWS ParallelCluster 3.6.0 で RHEL 8 をサポートしました
大村 保貴
2023.05.23
[アップデート] Amazon Omics Storage のシーケンスストアへファイルを直接保存できるようになりました
大村 保貴
2023.05.21
Nextflow 入門 Hello World ワークフローの実行内容を解説
大村 保貴
2023.05.20
Nextflow の概要と AWS サービスとの関係性を IT エンジニア向けに紹介
大村 保貴
2023.05.14
[アップデート] AWS Batch のダッシュボード表示をカスタマイズできるようになりました
大村 保貴
2023.05.11
EC2（Ubuntu 22.04 LTS）に Nextflow の実行環境を構築してみた
大村 保貴
2023.05.03
Nextflow のローカル開発環境のために Docker コンテナを利用してみてわかったこと
大村 保貴
2023.05.03
AWS Batch で OpenMPI を使った並列ジョブの実行をやってみた
大村 保貴
2023.05.03
AWS Batch プレイスメントグループの指定ミスでサブミットしたジョブが [RUNNABLE] のまま止まっているときの対処方法
大村 保貴
2023.04.29
S3 へユーザー認証付きでファイルをアップロードする Amplify のサンプルアプリを試してみた
大村 保貴
2023.04.23
AWS ParallelCluster の計算リソースでかかった費用を把握する方法を調べてみた
大村 保貴
2023.04.22
VPC Lattice の VPC Lattice Service を Resource Access Manager で共有してクロスアカウント接続をやってみた
大村 保貴
2023.04.19
[アップデート] Amazon EFS の Elastic Throughput モードの最大スループット性能が3倍になりました
大村 保貴
2023.04.18
VPC Lattice クロスアカウント接続に必要な要素を図解してみた
大村 保貴
2023.04.17
AWS ParallelCluster ヘッドノードとコンピュートノードの IAM ロールに複数の IAM ポリシーをアタッチするコンフィグの記述方法
大村 保貴
2023.04.11
CloudWatch Logs 取り込みデータ量の多いロググループ名の確認方法
大村 保貴
2023.04.05
Amazon EBS Snapshots Archive の制約事項と AMI をアーカイブするために検討したことをまとめました
大村 保貴
2023.04.02
Amazon Omics Analytics の Variant Store へファイルの一括インポートができるようになりました
大村 保貴
2023.04.01
Bioconda 入門 Anaconda、Minicondaとの違いと EC2 に実行環境をセットアップしてみた
大村 保貴
2023.03.28
Amazon S3 バケットのリクエスタ支払いをスイッチロール先のアカウントから受け付ける方法
大村 保貴
2023.03.26
AWS Batch の Fargate タイプで最大 200 GiB のエフェメラルストレージを利用できるようになりました
大村 保貴
2023.03.23
【書評】新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門
大村 保貴
2023.03.21
Docker コンテナで動く Amazon Genomics CLI 実行環境の作り方紹介
大村 保貴
2023.03.19
ChatGPT を使ってちょうど読んでいた論文を3行まとめにしてもらった
大村 保貴
2023.03.17
Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ戻すまでの所要時間を調べてみた
大村 保貴
2023.03.12
Amazon Omics Storage ストレージクラス Archive から Active へ変更する方法2選
大村 保貴
2023.03.11
AWS ParallelCluster クラスター単位でコスト配分タグを付与するコンフィグ設定
大村 保貴
2023.03.07
Amazon Omics Workflows ZIP 圧縮したワークフロー定義ファイルのディレクトリ構成を誤った場合のエラーの出力例
大村 保貴
2023.03.04
Amazon Omics Storage に保存したファイルのメタデータから files の項目が表示されるケースとされないケースの違いを調べてみた
大村 保貴
2023.02.26
Amazon Omics Analytics の Annotation Store で定義可能なスキーマの型の確認方法
大村 保貴
2023.02.22
Amazon Omics Analytics へ GFF ファイルをインポートする前に拡張子を確認しましょう
大村 保貴
2023.02.22
Amazon Omics Analytics に保存したバリアントファイルとアノテーションファイルを Athena から検索してみた
大村 保貴
2023.02.18
Amazon Omics Analytics の Annotaion Store へファイルインポートに失敗したときの切り分け方法
大村 保貴
2023.02.15
Amazon Omics を利用するときに役に立つ資料まとめ2023年版
大村 保貴
2023.02.12
Amazon Omics に登場するデータフォーマットを整理してみた
大村 保貴
2023.02.11
Amazon Omics Analytics のアノテーションストアへデータ保存時の関連要素を図解してみた
大村 保貴
2023.02.06
リファレンスゲノムがまだこの世に存在しないけど Amazon Omics Storage へリードを保存したいときに試した方法
大村 保貴
2023.02.04
Amazon Omics Storage リファレンスストアは圧縮したファイル形式には対応していないためインポートする前に確認しましょう
大村 保貴
2023.02.04
AWS ParallelCluster 3 では共有ストレージのマウント先に /mnt 直下を指定できなくなりました
大村 保貴
2023.01.31
Amazon Omics Storage マネージメントコンソールからシーケンスストアへインポートジョブの実行方法が改善されました
大村 保貴
2023.01.24
Amazon Omics Storage と S3 でゲノムデータを保存する場合のコストを比較してみた
大村 保貴
2023.01.20
Amzon Omics Storage からリファレンスストアを削除するための前提条件を確認してみた
大村 保貴
2023.01.18
Amazon Omics Storage のリファレンスストアは1リージョンに1つまでの作成上限があります
大村 保貴
2023.01.17
Amazon Omics の Omics Storage へデータを保存する手順を図解してみた
大村 保貴
2023.01.16
AWS ParallelCluster 3.4 で有効化できるプレイスメントグループの仕様を確認してみた
大村 保貴
2023.01.15
EBS ボリュームの状態がエラーになったときの対処方法
大村 保貴
2023.01.14
AWS ParallelCluster 3.4.0 でコンピュートノードのマルチ AZ 起動をサポートしました
大村 保貴
2023.01.11
Amazon CloudWatch Logs の PutLogEvents API の単一ログストリームあたりのリクエストクォータがなくなり制限が緩和されました
大村 保貴
2023.01.05
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